O FC Atlético possui Centro de Treinamento próprio, e em cinco anos já atingiu importantes marcas, tendo disputado nesse tempo, além do Campeonato Cearense Série A, Copa do Brasil, Copa São Paulo de Futebol Júnior, Brasileirão de Série D e em 2022 disputou pela primeira vez na história o brasileirão da série C, competição que possui equipes tradicionais do Brasil.